MAN 3 Kota Makassar memiliki Fasilitas yang Lengkap dan Moderen :
1. Ruang kelas ber-AC dan dilengkapi SmartTV.
2. Laboratorium Terpadu.
3. Laboratorium Digital.
4. Laboratorium Keagamaan.
5. Laboratorium Keterampilan.
6. Pembelajaran Berbasis Digital Terintegrasi.
7. Perpustakaan.
8. Kantin Sehat.
9. Mal Pelayanan Publik.
10. Pelayanan Digital Terintegrasi dalam satu aplikasi eSIPAKATAU.